École d'été: Analyse des pistes en écologie (ECL 705, ECL 805)

Du 3 au 8 mai 2015

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Description des cours

Coût

Attribution des crédits

Informations nécessaires pour l'inscription

Comment s'inscrire

Comment réserver une chambre à la Réserve Gault à Mont Saint-Hilaire

Comment se rendre à la Réserve Gault à Mont Saint-Hilaire.

Documents et fonctions R à télécharger avant le début du cours

Description des cours

ECL 705  Analyse des pistes en écologie I (cours de deuxième cycle)

ECL 805 Analyse des pistes en écologie II (cours de troisième cycle)

Les écologistes posent souvent des hypothèses de cause et effet comprenant plusieurs variables portant sur des systèmes dans lesquelles des expériences de manipulation contrôlée en placement aléatoire ne sont pas possibles.   Dans de tels cas, ces hypothèses causales doivent être évaluées par une méthode statistique, la modélisation par équations structurelles, souvent aussi appelée « l’analyse des pistes ».  Dans ce cours intensif de cinq jours vous apprendrez les bases théoriques et pratiques de cette méthode statistique et comment l’appliquer dans vos recherches en écologie.  Les séances théoriques seront interposées par des séances pratiques en utilisant le logiciel gratuit R.  Vous êtes invités à utiliser vos propres bases de données autant que possible.  Les deux cours comprennent un examen.  Le contenu des deux cours est identique sauf que le cours de troisième cycle (ECL 805) comprend en plus un travail écrit facultatif qui sera soumis  après le cours.  L’inscription est limitée à 32 personnes.  Vous pouvez arriver à partir du 16h le 3 mai 2015.  Le cours commencera le 4 mai immédiatement après le petit déjeuner.  Vous devez quitter vos chambres avant 16h le 8 mai.

Le contenu du cours suit le livre: Shipley, B. 2000. Cause and correlation in biology: A user's guide to path analysis, structural equations, and causal inference.  Cambridge University Press.  Vous pouvez le commander par Amazon.

 

Puisque nous visons un groupe international, la langue d'enseignement sera l'anglais mais les questions en français seront les bienvenues.  En association avec le Centre d’Étude de la Forêt (CEF) et le Centre de la Science de la Biodiversité du Québec (CSBQ), les cours auront lieu à la Réserve Naturelle Gault de l’Université McGill à Mont Saint Hilaire, Québec.  Les bourses sont disponibles aux  étudiants membres de ces deux Centres pour payer les frais de logement et de nourriture (voir les sites web pour plus de détails) mais vous êtes entièrement responsable pour de telles bourses.

 

Préalables

(1) Être étudiant de 2e (MSc) ou 3e (PhD) cycles (ou équivalent) ou post-doc. La priorité sera donnée aux personnes officiellement inscrites.  Auditeurs libres qui veulent qui veulent une chambre seront acceptés uniquement si l'inscription comprend moins que 24 personnes ou si vous acceptez de vous déplacer à chaque jour à la Réserve Naturelle Gault.

(2) Avoir des connaissances de base en analyse statistique (tests inférentiels, corrélation, régression et modèles linéaires).

(3) Avoir des connaissances de base dans le logiciel R.

(4) Avoir un ordinateur portable avec le logiciel R installé avant le début du cours.  Vous pouvez installer ce logiciel gratuit ici.  Il faut aussi télécharger et installer les deux bibliothèques: lavaan et ggm.

Coûts

Les frais d’inscription aux cours sont assumés par la Faculté des sciences de l’Université de Sherbrooke.

Le coût pour le logement et la nourriture à la Réserve Naturelle Gault de l’Université McGill à Mont Saint-Hilaire, Québec est 326$  CAN par étudiant, payable avant le 15 avril 2015.  Pour réserver une chambre et pour payer les frais de 326$, SVP aller au http://registration.qcbs.ca/pay/ et faire le paiement en ligne.

Demande de reconnaissance

Ces cours font partie du cursus des cours de cycle supérieur du Département de biologie. Les étudiants provenant d’une autres université québécoise, et qui veulent que le cours soit reconnu (accepté) dans leur programme d’études, doivent s'inscrire et obtenir l’autorisation d’études hors établissement  par le CREPUQ ici: https://mobilite-cours.crepuq.qc.ca/4DSTATIC/FRAccueil.html.

Les étudiants qui veulent faire reconnaitre ce cours dans le cursus de leurs propres cours et qui sont inscrits dans une université hors Québec doivent s'informer auprès de leur propre institution pour connaître les modalités d’une demande de reconnaissance d’acquis.  Un relevé de notes non officiel sera posté. 

Pour obtenir un relevé de notes officiel : http://www.usherbrooke.ca/etudiants/services-universitaires/demandes-de-documents-officiels/

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Informations nécessaires pour l'inscription

 

Étudiants inscrits à l'Université de Sherbrooke: simplement vous inscrire à partir de votre fiche d'inscription et puis m'avertir par courriel: Bill.Shipley@USherbrooke.ca

Étudiants inscrits dans une autre université québécoise: vous inscrire à travers le CRÉPUQ:  https://mobilite-cours.crepuq.qc.ca/4DSTATIC/FRAccueil.html et puis m'avertir par courriel: Bill.Shipley@USherbrooke.ca

 Toute autre personne:  Remplir ce formulaire d'inscription et me l'envoyer avec les copies des autres documents demandés.  Vous pouvez me les envoyer  par courriel ou par la poste au Département de biologie, Université de Sherbrooke, Sherbrooke (Québec), J1K 2R1, Canada.

 

Renseignements sociologiques

  • Nom

  • Prénom

  • Citoyenneté

  • Nom de la ville et du pays de naissance

  • Nom de la mère (nom de jeune fille)

  • Prénom de la mère

  • Nom du père

  • Prénom du père

  • Adresse de correspondance

  • Adresse de courriel

En plus:

Si vous avez un statut d'étudiant au Québec autre que l'Université de Sherbrooke:

  • Québécois : numéro de code permanent et copie du certificat de naissance

  • Canadien d'une autre province : copie du certificat de naissance

  • Résident permanent : copie recto-verso de la carte de résidence permanente, copie du certificat de naissance et copie du CSQ (certificat de sélection du Québec) s’il y a lieu

  • Résident permanent devenu Canadien : copie recto-verso de la carte de citoyenneté, copie du certificat de naissance

  • International : copie du passeport, copie du CAQ (certificat d’acceptation du Québec) et copie du permis d’études

 Si vous avez un statut d'étudiant au Canada mais hors Québec:

  • Québécois : numéro de code permanent et copie du certificat de naissance

  • Canadien d'une autre province : copie du certificat de naissance

  • Résident permanent : copie recto-verso de la carte de résidence permanente, copie du certificat de naissance

  • Résident permanent devenu Canadien : copie recto-verso de la carte de citoyenneté, copie du certificat de naissance

  • International : copie du passeport et copie du permis d’études

Si vous n'avez pas un statut d'étudiant au Canada:

  • Canadien: copie du certificat de naissance

  • Résident permanent : copie recto-verso de la carte de résidence permanente, copie du certificat de naissance et copie du CSQ (certificat de sélection du Québec) s’il y a lieu

  • Résident permanent devenu Canadien : copie recto-verso de la carte de citoyenneté, copie du certificat de naissance

  • International : copie du passeport

Comment s'inscrire?

Lisez attentivement la section "informations nécessaires pour l'inscription" et obtenir les informations demandées. Ensuite, suivre les information en haut.

 

La date limite pour faire l'inscription, incluant la réception de tous les documents nécessaires, est le 15 mars 2015.

Comment réserver une chambre à Mont Saint-Hilaire

 Votre chambre sera automatiquement réservée suite à la réception de votre paiement .  SVP aller au http://registration.qcbs.ca/pay/ et faire le paiement en ligne. Cette réservation comprend un lit dans les dortoirs et la nourriture.  Par contre, vous devez apporter des serviettes et un sac à couchage.

 

Comment se rendre à la Réserve Gault à Mont Saint Hilaire.

La réserve naturelle Gault:
422, chemin des Moulins
Mont-St-Hilaire (Québec)
J3G 4S6
Tél. : 450-467-4010
Fax : 450-467-4074

 .

·Un taxi de l'aéroport Trudeau est environ $130.  De l'aéroport il faut prendre le Taxi Coop 514-725-9885.  De Mont Saint-Hilaire,il faut prendre le Taxi Central de Beloeil 450-467-2888.  

 

·         Par transport publique de l'aéroport, il faut prendre l'autobus 747 jusqu'à “Berri UQUAM”.  Ensuite, prendre le métro à “Longueuil-Université de Sherbrooke”. Ensuite, prendre l'autobus 200 vers St-Hyacinthe et décendez à“Pont Mont Saint-Hilaire” (à côté de la station ESSO et l'affiche  Mont -Saint-Hilaire ).  Finalement, il faut prendre un taxi jusquà la Réserve Gault

 

http://www.stm.info/english/info/a-747.htm  Pour le Métro

http://www.citvr.ca/horaires.php#HCRegionaux Pour l'autobus

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Documents et fonctions R à télécharger avant le début du cours

 

Présentations powerpoint (en anglais, optionnel)

d-separation and exploratory methods (PPT)

path analysis and maximum likelihood (PPT)

measurement models and maximum likelihood (PPT)

Fonctions dans R

 MCX2

 EPA

 Shipley.test2

Documents

A cheatsheet in R for ggm and lavaan

An introduction to lavaan